PacBio REVIO - long-read sekvenaator

PacBio REVIO - long-read sekvenaator

Revio süsteemi töölaual on neli sekveneerimisreaktsiooni, mis on üksteisest eraldatud. See jätab süsteemi avatuks ehk uusi reaktsioone saab masinasse laadida kuni 20 tundi ööpäevas, hoides samal ajal kõik sekveneerimiseks olulised etapid töös.
 

Nutikad lahendused vähendavad plastiku kasutamist ning ökoloogilist jalajälge:

Revio süsteemil on ainult kolm töölaua kulumaterjali – SMRT®Cell sekveneerimiskiip, SMRT®Cell sahtel ja pipetiotsikud. 

Sekveneerimiskiibil on NFC-silt, mis võimaldab kiibi automaatselt siduda ja käivitada eelnevalt loodud disainiga sekvenaatori tarkvaras. See võimaldab kiiret töö käivitamist instrumendil.
Revio sekveneerimiskiip ühendab üheks kõik selle, mis varem oli neljaosaline - Üks standardne 96 süvendiga plaat sisaldab raamatukoguproove, reaktiive ning ruumi segamiseks ja jäätmeteks.

Reviol sekveneerimine on nüüd soodsam ja keskkonnasõbralikum: korduvkasutatav SMRT Cell sekveneerimiskiip on kasutatav kuni kolm sekveneerimistsüklit

PacBio sekveneerimisplatvorm on peale nukleotiidide järjestuse määramise võimeline määrama ka DNA metülatsiooni. Template nukleotiidi metülatsioon arvutatakse polümeraasi kineetikat analüüsiva algoritmi abil.

Andmeid esitatakse tõhusamalt: Faili suurus on 50% väiksem ühe nukeotiidi (base) kohta – see on 20 korda väiksem kui teiste long-read tehnoloogiate puhul. 

  • 50% väiksemad väljundfailide hoiustamiskulud
  • Kõrge läbilaskevõime – kuni 1300 HiFi genoomi aastas

Veel eeliseid

  • PacBio süsteemid on tuntud NGS valdkonnas pikimate lugemite poolest. Need on eriti kasulikud genoomi keeruliste piirkondade, näiteks korduvate järjestuste, kätte saamiseks.
  • SMRT sekveneerimine loeb otse DNA molekuli, ilma et oleks vaja eelnevat PCR amplifikatsiooni. See võib vähendada teatud nihkeid ja vigu, mis võivad PCR käigus tekkida.

Koduleht:

https://www.pacb.com/revio/

Info:

Brošüür (eng)

Tutvustav video: Reveal more with accurate long-read sequencing at scale

Auhinnad:

Revio võitis "R&D World" Top100 auhinna: "2023 Top 100 World Winners"

Revio võitis MedTechi auhinna "Parim üldine genoomikalahendus" (2023)

Täpsema info saamiseks võta ühendust: